Baltijos regiono istorijos ir archeologijos institute 2025 m. birželio 30 d. dirbo 38 darbuotojai, užėmę 33,48 etato. Darbuotojų veikla yra finansuojama iš Klaipėdos universiteto gaunamų valstybės asignavimų, Instituto darbuotojų konkursine tvarka laimėtų nacionalinių ir tarptautinių mokslinių tyrimų projektų, Instituto atliekamų užsakomųjų ūkiskaitos darbų.
Mokslo ir pedagoginėse pareigose dirbo 35, iš jų mokslo darbuotojų pareigose – 27 tyrinėtojai (22,73 etato). Visi Instituto mokslo darbuotojai vykdo grupinius ir / ar individualius mokslinių tyrimų projektus, kuriais prisideda prie prioritetų įgyvendinimo Klaipėdos universiteto strateginėse mokslo kryptyse.
Pedagoginėse pareigose užimta 5,42 etato. Administracinėse pareigose (direktorius, direktoriaus pavaduotojas, vyr. specialistas, studijų specialistas) užimti 4 etatai. Pagalbinis ir techninis personalas sudarė 1,33 et.