Magistro kvalifikacinio laipsnio siekiantiems studentams Klaipėdos universiteto Baltijos regiono istorijos ir archeologijos institutas siūlo studijuoti vieną nuolatinių studijų II pakopos programą:
Baltijos šalių istorija* (programos kodas 6211NX051);
* Galimybė rinktis karybos istorijos specializaciją
KU Senato nutarimu, 2023 m. vykdomas priėmimas į šią studijų programą.
Istorijos krypties studijas Klaipėdos universitete Studijų kokybės vertinimo centras 2021 m. yra akreditavęs maksimaliam septynerių metų laikotarpiui.
Asmenims, kurie turi profesinio bakalauro kvalifikacinį laipsnį (yra įgiję aukštąjį koleginį išsilavinimą), ir nori studijuoti Baltijos šalių istorijos studijų programoje, yra skirtos papildomosios studijos.